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在中国实现24小时精准医疗(20页).pdf

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在中国实现24小时精准医疗(20页).pdf

1、李亚东亚太区总经理英特尔医疗与生命科学集团在中国实现24小时精准医疗法律声明英特尔技术特性和优势取决于系统配置,并可能需要支持的硬件、软件或服务得以激活。产品性能会基于系统配置有所变化。没有计算机系统是绝对安全的。更多信息,请见,或从原始设备制造商或零售商处获得更多信息。在特定系统中对组件性能进行特定测试。硬件、软件或配置的任何差异都可能影响实际性能。请进行多方咨询,以评估您考虑购买的系统或组件的性能。关于性能及基准数据的更完整的信息,敬请登陆:http:/ SYSmark 和 MobileMark 等测试均系基于特定计算机系统、硬件、软件、操作系统及功能,上述任何要素的变动都有可能导致测试结

2、果的变化。请参考其它信息及性能测试(包括结合其它产品使用时的运行性能)以对目标产品进行全面评估。更多信息请访问 http:/ SEC 报告中包含关于可能影响英特尔结果和计划的因素的详细讨论,包括有关 10-K 报表的年度报告。所有涉及的所有产品、计算机系统、日期和数字信息均为依据当前期望得出的初步结果,可能随时更改,恕不另行通知。所述产品可能包含设计缺陷或错误(已在勘误表中注明),这可能会使产品偏离已经发布的技术规范。英特尔提供最新的勘误表备索。英特尔不对本文中引用的第三方基准数据或网站承担任何控制或审计的责任。您需要访问参考网站以确认所引用数据是否准确。英特尔、英特尔标识、Intel.Exp

3、erience Whats Inside 标识是英特尔公司在美国和/或其他国家的商标。*其他的名称和品牌可能是其他所有者的资产。2016英特尔公司版权所有。所有权保留。The Time of Precision Healthcare Is NOW and is REAL!精准医疗并非遥不可及,而是愈行愈近医疗发展的趋势 精准医疗呼啸而来的基因组数据+影像学数据+临床数据 洪水猛兽般的海量数据医疗体系的变革-在路上 循证医学为核心,越来越受重视 基于肿瘤和微环境的分子基础制定治疗方案精准医疗处于爆发点 1000美金基因组测序已经成为现实 组学和影像学基础 之上的分析正成为标准方案,而且极有可能在

4、几年之内惠及亿万人群精准医疗是数据驱动的科学 一个人的分析过程即可能产生TB(terabyte)级数据 精准医疗的充分实施将涉及对成千上万人群数据的整合分析Intel对精准医疗的定位-BT+IT的双剑合璧今天:多种多样分散,孤立,未充分利用的数据类型未来:整合的具有临床可操作价值(clinically-actionable)的信息实现更好的医疗/临床决策 病患/个人为主导的方法 群体健康结果为导向 价值驱动的医疗健康方案,追求更高质量兼顾成本控制GenomicsClinicalClaims&transactionsMeds&labsPatient experiencePersonal data

5、 5精准医疗=复杂的大数据和计算机技术的生态系统Precision Medicine=Complex Big Data and Compute Ecosystem精准医疗=BT+IT:我们面临的主要挑战Raw sequencing data sets are large,impractical to shareCritical diagnosis,treatment pipelines can take weeksDifficult to protect patient privacy while sharing diagnosis,treatment dataGenomic sequenci

6、ng outpacingcapabilities of current architectures数据量Data management处理速度Workflow efficiency安全和分享Privacy protection可扩展性Increasing requirements精准医疗计算的主战场:数据和分析数据搜集和管理分散个人健康信息保护和隐私顾虑大部分数据没有审核校对和定量分析过 病患和个人的原始医疗健康数据未经授权移动是禁止的缺乏行业标准分析需要消耗大量计算资源电子健康记录/病历和临床检测数据之间的联系极弱甚至缺乏流程通常需要花费数天乃至数周软件生态系统零碎化大多数机构无经费承担人员

7、和硬件投入有效的临床决策系统(CDS)需要整合多中心来源的数据和治疗结果公共数据并不易获得,运行分析也需要大量的IT架构和设备的投入数据分析技术之外的挑战教育教育政策政策支付和保险支付和保险投资和创新投资和创新Sustain and grow,including White House Precision Medicine InitiativePrivacy and consent policies must allow secure access to health data while protecting confidentialityThe next generation of bio

8、-informaticians,clinicians,and patients must be educatedValidate the benefits and evidence of precision medicine and set standards 全基因组分析为核心(多组学水平)的精准医疗到2020年之前,一天之内完成!1234Imaging,parallelism,statistical work,accelerated algorithmsVarious algorithms,big data,parallelism,accelerated algorithms,statis

9、tical and math puzzles,in memory processing+imaging+ML+drug sensitivity assays+mechanistic learning and systems+correlation work and knowledge systems1-4 daysMonths&In ResearchWeekWeeks初次分析二次分析:各种DNA/RNA分析流程精准诊断和治疗HCHCHCHCHCHCHCHCHCHCMultiple sample compute starts hereJoint genotypingVariantstorePop

10、/DisstudyIndividualMultiple individualPredicted Actionable VariantsData Driven Association Clinically Actionable VariantsKnowledge DatabaseClinical trail groupsData curationChemical/Optical process to read genomic strings and digitize dataAlign and prepare genomic data for a single sampleMerge stati

11、stical information for multiple samples and find variantsAnalytics using genotype and phenotype dataALL IN ONEDAY BY 20202020年之前,实现24小时精准医疗英特尔正在多方位为实现 24小时实现精准医疗而努力二次分析2x-4x*http:/www.bio- source:https:/ in Bioinformatics,March 2015,doi:10.1093/bioinformatics/btv179For more complete information abou

12、t performance and benchmark results visit http:/ http:/bioinformatics.oxfordjournals.org/content/early/2015/04/15/bioinformatics.btv179.fullhttp:/ version 20151012 For select workloads and functions on 16 core HSW-EP.Results are initial observations*Other names and brand may be claimed as the proper

13、ty of othersHALVADE*40 x*机器学习1.5X 1.5x-15X Global training in bioinformatics基因数据和临床分析一体机市场孵育、流程和业务创新1-10+TFLOPS1-3+TB20+Tools*5+workflows*FastQC,Bowtie,Bwa,Annovar,Bedtools,Cufflinks,Gatk,Tophat,Picard,Abyss,SOAPsnp,Targetscan,Trinity,Deseq,Samtools,Blast,velvet,*Whole Genome Resequencing.Whole Exom

14、e Sequencing,De novo Assembly,Transcriptome Analysis,Small RNA Analysis,Digital Genomic Expression,ChIP-Seq,Methylation Analysis英特尔正在多方位为实现 24小时实现精准医疗而努力2U PlenumActual placement in racks may vary.NSS-HA Pair NSSUserDataHSS Metadata PairHSS OSS Pair HSSUserDataENACT:Exploring Novel Approaches to Car

15、e Transformation在中国弯道超车的机遇1.政府投入,政策宽松2.产业跟进,学术创新3.需求迫切,消费驱动我们在中国力促实现“24小时精准医疗”All In One DayBioIT Partners Initiative“精准医疗伙伴计划”Collaborative Children Health Cloud“儿童协同健康云”英特尔/阿里云/华大基因 精准医疗云平台云计算云计算应用本地测序和计算方案Announced Oct 2015PaaSBGI Online for CloudSaaSBenchtop SequencerAppliance(IA+BGI online for

16、Client)DataDataResultsDataClinical UsagesPharmaceutical UsagesResearch Usages云计算DATA EXCHANGE 的核心技术组成16All open source technologies,interAll open source technologies,inter-operable with community standards and operable with community standards and best practicesbest practices.Acceleration of Omics a

17、nd Imaging WorkflowsAccelerate runtimes an order of magnitudeAll in a Day高性能计算和加速Scalable Genomic DatabasesStore vast amounts of patient variant data and perform in-database computationScalability at All Levels可扩展性Federated Cloud OrchestrationKeep Data Local at Hospital/InstitutionSend COMPUTE to DA

18、TA分享算法而非数据Privacy-Preserving Data SharingPerform secure joint computations across multiple sites while preserving privacySecure Sharing安全和隐私保证上海交通大学/上海市儿童医院/英特尔公司儿童健康协作云(Collaborative Children Health Cloud,CCHC)一个开放、安全、高效的精准医学协作平台,促进医疗体系内部创新服务儿童医院医学联合体、上海交大的医疗和科研网络,并逐步建立扩展到全国精准医疗体系的示范模式连接病患、医院、医疗服务提

19、供方、基因测序服务方、医药公司、科研院所和保险机构Childrens hospital ALocal Big DataLocalLocalComputeComputeCentral FunctionLocal Big DataChildrens hospital BLocal Big DataLocalLocalComputeComputeCloud For Public Data(future work)Shared DataWorkflow orchestrationLocalLocalComputeComputeSecurity with Harmony Point儿童健康协作云CCHCBT+IT协作创新,在中国实现24小时精准医疗

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