《防控猪蓝耳病的新策略, 吉欧万尼·特勒维萨爱荷华州立大学.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《防控猪蓝耳病的新策略, 吉欧万尼·特勒维萨爱荷华州立大学.pdf(70页珍藏版)》请在三个皮匠报告上搜索。
1、防控猪蓝耳病的新策略防控猪蓝耳病的新策略Giovani Trevisan,DVM,MBA,PhD助理教授爱荷华州立大学trevisaniastate.eduThank you very much!Source:https:/美国猪群数量和定期的猪繁殖与呼吸综合征病毒美国猪群数量和定期的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)检测)检测US Census of agriculture,2017 https:/www.nass.usda.gov/Publications/AgCensus/2017/Online_Resources/Ag_Atlas_Maps/17-M211g.php 了解种猪群的猪蓝
2、耳病(了解种猪群的猪蓝耳病(PRRSV)患病)患病率率了解种猪群的猪蓝耳病患病情况了解种猪群的猪蓝耳病患病情况Nave/NegativePositive Stable,MLVPositive unstablePositive stable,FVISource MSHMP:https:/vetmed.umn.edu/centers-programs/swine-program/outreach-leman-mshmp/mshmp 净化/阴性阳性稳定,弱毒苗阳性不稳定阳性稳定Source MSHMP:https:/vetmed.umn.edu/centers-programs/swine-prog
3、ram/outreach-leman-mshmp/mshmp 逐增的猪蓝耳病发病率逐增的猪蓝耳病发病率22-23Source MSHMP:https:/vetmed.umn.edu/centers-programs/swine-program/outreach-leman-mshmp/mshmp 13-1411-1222-23逐增的猪蓝耳病发病率逐增的猪蓝耳病发病率Source MSHMP:https:/vetmed.umn.edu/centers-programs/swine-program/outreach-leman-mshmp/mshmp 21-2213-1411-12逐增的猪蓝耳病发
4、病率逐增的猪蓝耳病发病率22-23了解猪蓝耳病了解猪蓝耳病(PRRSV)在大流行病学方在大流行病学方面的检测方法面的检测方法猪蓝耳病的检测样本总数及结果猪蓝耳病的检测样本总数及结果www.fieldepi.org/SDRS 育肥猪的蓝耳病阳性率更高育肥猪的蓝耳病阳性率更高www.fieldepi.org/SDRS 育肥猪的蓝耳病阳性率更高育肥猪的蓝耳病阳性率更高www.fieldepi.org/SDRS 育肥猪的蓝耳病患病率的上升总是比母猪群体患病育肥猪的蓝耳病患病率的上升总是比母猪群体患病率的上升多率的上升多www.fieldepi.org/SDRS 猪蓝耳病猪蓝耳病:区域性检测区域性检测=
5、可知的疾病管控措施可知的疾病管控措施www.fieldepi.org/SDRS 主动监测主动监测 PCR 数据是检测新蓝耳病毒株出现的关键数据是检测新蓝耳病毒株出现的关键 www.fieldepi.org/SDRS 监控汇总的诊断数据有助于快速确认动物健康监控汇总的诊断数据有助于快速确认动物健康和生产风险和生产风险SDRS:Swine Disease Reporting System:https:/www.fieldepi.org/SDRS 监控汇总的诊断数据有助于快速确认动物健康监控汇总的诊断数据有助于快速确认动物健康和生产风险和生产风险Abnormal drop in Ct values
6、to historical lowest levels.More requests for PRRSV ORF5 sequencing.值异常下降到历史最低水平要求对 PRRSV ORF5 测序的更多 New PRRSV strain:PRRS 1-4-4 L1C variant SDRS:Swine Disease Reporting System:https:/www.fieldepi.org/SDRS 监测蓝耳病毒测序以了解病毒演变和区监测蓝耳病毒测序以了解病毒演变和区域性动态检测域性动态检测https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MW887655 202
7、1年年5月,行业合作伙伴和月,行业合作伙伴和ISU公开了公开了L1C变异株变异株全基因组全基因组U.S.&China PRRSV strains&L1C variant美国和中国L1C变异株的定位ChinaChinaChinaChinaLineage 1 C variantNADC30NADC34蓝耳病毒毒株检测:跨区域动态蓝耳病毒毒株检测:跨区域动态(2022 年年 1 月至月至 6 月月)开发用于猪蓝耳病毒监测的新型样本开发用于猪蓝耳病毒监测的新型样本Processing FluidOral FluidSerumLungBlood/swabMultiplewww.fieldepi.org/
8、SDRS 最新进展最新进展个体个体 vs.群体样本群体样本Lopez,et al 2018正在加工中的液体正在加工中的液体Image courtesy Dr.Zimmerman1234Prickett,et al.2008口腔液体口腔液体Image courtesy Dr.Marcelo Almeida家族的口腔液体家族的口腔液体qPCRTT average per bag=8舌尖渗出物采集法舌尖渗出物采集法Machado,et al.2022汇集大量样本是在低发病率时监测猪蓝耳病毒和识别汇集大量样本是在低发病率时监测猪蓝耳病毒和识别病毒活动的好方法病毒活动的好方法Processing flu
9、id-PRRSVLopez,et al.2021汇集大量样本是在低发病率时监测猪蓝耳病毒和识别汇集大量样本是在低发病率时监测猪蓝耳病毒和识别病毒活动的好方法病毒活动的好方法Processing fluid-PRRSVFamily oral fluid-PRRSVLopez,et al.2021Cycle threshold(Ct)Osemeke,et al.202245403530Category ACategory BCategory CB(1 in 3)C(1 in 5)D(1 in 10)E(1 in 20)A(Stock)Dilution 使用监测和诊断结果对不同批次进行分类并且预测使
10、用监测和诊断结果对不同批次进行分类并且预测Trevisan,et al.2020使用监测和诊断结果对不同批次进行分类并且预测使用监测和诊断结果对不同批次进行分类并且预测Trevisan,et al.2020 战略性地使用免疫干预来降低下游死亡率战略性地使用免疫干预来降低下游死亡率Moura et al.,2022.区域性猪蓝耳病毒管控计划区域性猪蓝耳病毒管控计划基于站点情况和区域筹划采取措施基于站点情况和区域筹划采取措施在区域范围内建立缓冲区 (+)Rings 环形在区域内建立环形缓冲区:以猪蓝耳病患病点为圆心,半径3英里范围内34Dr.Edison Magalhes,2022在环形缓冲区应采
11、取的措施:在阳性不稳定的养殖站点加倍疫苗剂量在 3 英里半径范围内的养殖站点(45 日龄)接种一剂,不论它是阴性组或阳性稳定组半径 3 英里内的阳性稳定母猪场应重进行每周监测计划,为期 90 天。保育期的小猪也应重启每周检测计划,为期90天监测指南监测指南&措施措施 低发病率阶段低发病率阶段(20%)35Dr.Edison Magalhes,2022实时诊断数据访问和通信实时诊断数据访问和通信疾控管理的时空性用测试结果和健康情况数据说明对不同站点的疾控方案进行分类36发病猪群的管控方案发病猪群的管控方案(POMP)发病猪群的管控方案发病猪群的管控方案(POMP)https:/www.field
12、epi.org/POMPTotal loss per thousand sows Cohort 2011Cohort 202110th percentile431,91025th percentile1,1742,363median2,7894,14475th percentile4,7555,55790th percentile6,0877,195 与与 2009-2012 年的群体对比,年的群体对比,2020-21 年年的的 POMP 猪群具有:猪群具有:-更长的TTLP(平均+9周)-更长的 TTBP(平均+6 周)-更严重的损失+1,355 头未断奶的猪/1k头母猪达到低发病率的时间达
13、到低发病率的时间-TTLP高免疫力高免疫力100%80%60%40%20%0%Time to low prevalenceYESNO淘汰淘汰(是是 或或 否否)和和 达到低发病率的时间(达到低发病率的时间(TTLP)100%80%60%40%20%0%Time to baseline productivityYESNO100%80%60%40%20%0%Time to low prevalence批量管理体系可以更快地达到低发病率批量管理体系可以更快地达到低发病率4 or bi-weekly batchWeekly达到基本生产力的时间达到基本生产力的时间-TTBP高免疫力高免疫力100%80%
14、60%40%20%0%Time to baseline productivityNOYes淘汰淘汰(是是 或或 否否)和和 达到基本生产力的时间达到基本生产力的时间(TTBP)100%80%60%40%20%0%Time to baseline productivityNOYesUnstableIII or IVStable100%80%60%40%20%0%weeks阴性猪群的达到基本生产力的时间阴性猪群的达到基本生产力的时间(TTBP)更长更长 Time to baseline productivity损失总量损失总量-TLTotal loss per thousand sows Coho
15、rt 2011Cohort 202110th percentile431,91025th percentile1,1742,363median2,7894,14475th percentile4,7555,55790th percentile6,0877,195P 1-2%的差异就代表不同的株全全 PRRSV 基因组的复原与基因组的复原与 Ct 值和样本类型相关值和样本类型相关n=95n=6n=21Trevisan,et al.2022,Transboundary and Emerging Diseasesn=95n=6n=21Trevisan,et al.2022,Transboundary
16、 and Emerging DiseasesGood WGS recovery successes 基因组成功复原基因组成功复原全全 PRRSV 基因组的复原与基因组的复原与 Ct 值和样本类型相关值和样本类型相关n=95n=6n=21Trevisan,et al.2022,Transboundary and Emerging DiseasesGood WGS recovery successes 基因组成功复原基因组成功复原Useful for understanding genetic diversity 对于了解基对于了解基因多样性非常有帮助因多样性非常有帮助全全 PRRSV 基因组的复
17、原与基因组的复原与 Ct 值和样本类型相关值和样本类型相关单个样本和集合样本可以用于不同方面的分析单个样本和集合样本可以用于不同方面的分析n=95n=6n=21Trevisan,et al.2022,Transboundary and Emerging DiseasesIndividual samples 个体样本个体样本Aggregated samples集合样本集合样本Individual samples个体样本个体样本种猪群中存在种猪群中存在 1 PRRSV 毒株是事实毒株是事实Trevisan,et al.2022,Transboundary and Emerging Diseases
18、具有具有 2 PRRSV毒株的农场达到低发病率之后的毒株的农场达到低发病率之后的12 周,具有周,具有 3 毒株的农场才达到低发病率毒株的农场才达到低发病率 3 strains 2 strainsTrevisan,et al.2022,Transboundary and Emerging Diseases 具有具有 2 PRRSV 毒株的农场比具有毒株的农场比具有 3 PRRSV毒株的农毒株的农场有更少的损失(场有更少的损失(1837头小猪头小猪/1000头母猪)头母猪)3 strains 2 strainsPiglet losses per 1,000 sows5,0004,0003,000
19、2,000p 0.1154 N=8N=10https:/www.fieldepi.org/POMP 检测到发生重组事件的农场比未发生重组事检测到发生重组事件的农场比未发生重组事件的农场损失更少(件的农场损失更少(1837头小猪头小猪/1000头母猪)头母猪)Piglet losses per 1,000 sowsYesNo5,0004,0003,0002,0001,000p 0.1177 N=11N=9https:/www.fieldepi.org/POMP 利用下一代测序技术和实地分析来检测多样的PRRSV毒株 具有 2 PRRSV毒株(n=11)的农场 比 具有 3 毒株(n=8)的农场早
20、12周达到稳定 具 3 毒株(n=8)的农场 比 具有 2 PRRSV毒株(n=10)的农场损失量更高(1837头小猪/1000母猪)Trevisan,et al.2022,Transboundary and Emerging Diseases利用下一代测序技术和实地分析来检测重组型利用下一代测序技术和实地分析来检测重组型PRRSV毒株毒株 17个农场中有12个农场检测到了重组型PRRSV毒株 12个农场中7个(58.3%)检测到了重组事件,并且都具有 3 PRRSV毒株 检测到了重组型PRRSV毒株(n=10)的农场比未检测到重组型毒株(n=8)的农场损失量更大(1827头小猪/1000母猪)Trevisan,et al.2022,Transboundary and Emerging Diseases重点总结重点总结监测诊断数据为应对猪蓝耳病的诊断信息提供了强大的工具猪蓝耳病的管控:需要结合诊断工具和干预法来降低猪蓝耳病的影响;为更好地了解猪蓝耳病毒毒株的循环、特征以及与生产结果相关而需要采取的管控措施,二代测序技术的应用为我们展现了非凡的前景;谢谢!Giovani Trevisantrevisaniastate.edu